Protein katlanmasında 8,6 kat hız

Google araştırmacıları, protein yapısı tahminini 8,6 kat hızlandıran bir yöntem geliştirdi. "Cerrahi epitop eksizyonu" adı verilen teknik, tasarlanan proteinin bağlanması beklenen bölgeye odaklanıyor; tüm hedef proteini işlemek yerine yalnızca yerel bölgeyi hesaplıyor. Google'a göre bu yaklaşım, testlerde yapısal doğruluktan ödün vermeden hız sağladı.

Kanserle ilişkili proteine bağlanan moleküller

Ekip, yöntemi katı tümörlerle ilişkilendirilen FAP (fibroblast aktivasyon proteini alfa) üzerinde uyguladı. Maya yüzeyi gösterimi ve floresansla etkinleştirilen hücre ayrıştırma yöntemleriyle aday proteinler tarandı. Laboratuvar deneylerinde en güçlü tasarımlar tek haneli nanomolar bağlanma afinitesine ulaştı; bu, sıkı bir moleküler etkileşime işaret ediyor.

Ajanlar DNA molekülleri ve robotlarla çalıştı

Aynı program kapsamındaki ikinci projede ajanlar, belirli proteinlere bağlanabilen kısa DNA molekülleri olan aptamerleri iyileştirdi. Üç tasarım-test turunda miyoglobin için %33,5, alfa-trombin için %42,1 isabet oranına ulaşıldı. Üçüncü projede tanıtılan VERID adlı dijital laboratuvar modeli, robotik ekipmanı, sıvı hacimlerini ve malzemeleri takip ederek ajanların deneyleri önceden simüle etmesini sağlıyor.

Henüz erken aşama

Google, üç projenin de ayrı gösterimler olduğunu ve sistemlerin deneysel kaldığını belirtiyor. Protein bağlayıcıların kanser tedavisi olarak güvenli veya etkili olduğu gösterilmedi. Şirket, robotik kontrol çerçevesini moleküler keşif iş akışlarıyla birleştirmeyi; insan gözetimi ve biyogüvenlik taramasını sürdürmeyi planlıyor.